Leur tolérance est excellente mais on peut retrouver en début de traitement : nausées, flatulences, céphalées, vertiges. Ces effets secondaires sont transitoires.
Risque de carences
Exceptionnellement l’oméprazole et l’esoméprazole peuvent induire des troubles natrémiques à l’origine d’une confusion mentale.
Hypomagnésémie: effet indésirable nécessicant un contrôle biologique en cas de traitement hypomagnésémiant (digoxine, diurétiques…)
On retrouve aussi des déficits en vitamine B12 et en fer
Malabsorption du calcium pouvant augmenter le risque de fractures.
Infections

L’augmentation du pH, contribue à le colonisation bactérienne du tractus digestif, mais aussi pulmonaire par broncho-aspiration
Risque d’infections digestives et pulmonaires.
- Colites à Clostridium difficile, infections à Salmonella, Shigella, Campylobacter…
- Pneumonies fréquentes chez le senior mais aussi chez le jeune enfant
Atteinte des reins
La néphrite interstitielle aiguë est un effet indésirable rare retrouvé principalement chez le sujet âgé. Elle se manifeste pet une asthénie, de la fièvre, des nausées, un rash…)
Cette atteinte rénale n’est pas liée à la durée d’exposition ni au dosage des IPP; elle est réversible dans la majorité des cas à l’arrêt du médicament.
Tous les IPP sont suspectés entraîner cet effet indésirable.